故事的序曲从国中一年级开始。长相乖巧可爱的少女吉冈双叶（内田真礼 配音）不擅长应付男生，总觉得男生很讨厌，唯独隔壁班的田中，在她眼中是一个特别的存在。然而，和田中的青涩恋情还没开始，就随着他的转校而凋谢。转眼间，双叶已经是高一学生。因为国中时曾经被班上的女生排挤，她决定伪装自己原本的样子。 在一个平常的课间，她意外遇见一个长得很像田中的男生，他的身高和声音都跟国中时相差很大，这个叫马渕洸（梶裕贵 配音）的男生究竟是不是当年那个腼腆秀气的田中？砰然心跳，稚嫩青涩的闪烁青春，已经拉开帷幕。
羽鸟智世（种崎敦美 配音）表面看来只是一个略微冷淡的平凡少女，实际上却隐藏着可怜的身世。年幼时，智世的母亲自杀，父亲离家出走，无处可去的他在十五岁那一年成为了商品被地下拍卖会组织卖给了名为艾利亚斯（竹内良太 配音）的魔法使。其实，智世拥有着夜之宠儿的特殊体质，能够在无意识之中吸收外界所散发的魔力，是十分稀有的物种。智世成为了艾利亚斯的助手，利用自己的超能力帮助艾利亚斯解决教会委托的任务。在此过程中，艾利亚斯的温柔和体贴不断的治愈着智世的内心，智世也渐渐学会了使用自己的能力去将周遭的世界改变的更加美好。
改编自内藤泰弘原作漫画《枪神》的原创新作动画《TRIGUN STAMPEDE》宣布制作系列完结篇
