《命运石之门第二季》主人公冈部伦太郎经历无数的苦难，跨越了尽头悲哀的放弃了挽救“她”的世界线的故事。 失意至底的冈部伦太郎。 被“封印”的“凤凰院凶真”。 担心他的伙伴们。 新登场的角色们。 未被拯救的“她”到底怎么了？ 《STEINS；GATE》中没有登场的新的角色迎来被描绘的“0”的故事。 是的，那里的“她”现在也在——
灰迴航一是個有過英雄夢，現在卻已放棄的平凡大學生。然而這樣的他，卻暗地裡穿著扮成歐爾麥特的服裝，假裝自己是職業英雄熱心助人並樂此不疲。過著一天天平凡日子的航一，有天卻遇上了未經許可在街頭辦演唱會的自稱偶像．POP☆STEP與自稱「專門清理垃圾的清道夫」的神秘面具男．手指虎，並捲了「義警團」的行動之中。以非法方式拯救人們的他們，是擾辭秩序的犯罪者，又或者是正義的自警團。「非法英雄」「義警團」的故事就此展開－!
